Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMG1P04279 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms