Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3O95983 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3O95983 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3O95983 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3O95983 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3O95983 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3O95983 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms