Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIN3BO75182 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms