Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPLO60437 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPLO60437 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPLO60437 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPLO60437 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPLO60437 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms