Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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