Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF1O43189 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF1O43189 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF1O43189 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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