Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN4O14817 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN4O14817 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN4O14817 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN4O14817 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN4O14817 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN4O14817 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN4O14817 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN4O14817 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN4O14817 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN4O14817 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms