Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOR1AO14656 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms