Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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