Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3C2AO00443 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms