Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C9orf92A6NGG3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms