Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms