Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT87PA6NCN2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT87PA6NCN2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms