Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSDA5PKW4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms