Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U3KQ87 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U3KQ87 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U3KQ87 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQ87 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQ87 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQ87 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQ87 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQ87 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQ87 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQ87 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms