Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN16Q9Y5I7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN16Q9Y5I7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms