Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN3Q9Y4C0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms