Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms