Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms