Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EMC9Q9Y3B6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMC9Q9Y3B6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms