Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG6Q9Y2V7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms