Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC4Q9Y296 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms