Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
INO80Q9ULG1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms