Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP25Q9UHP3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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