Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms