Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms