Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EXTL2Q9UBQ6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL2Q9UBQ6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms