Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms