Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRBP1Q9P2E9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms