Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHRF1Q9P1Y6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms