Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf78Q9NZ63 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf78Q9NZ63 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms