Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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