Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ASF1BQ9NVP2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms