Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNPLA3Q9NST1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms