Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms