Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms