Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A2Q9NQ11 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP13A2Q9NQ11 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms