Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms