Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR35Q9HC97 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms