Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms