Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM4Q9C037 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM4Q9C037 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM4Q9C037 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM4Q9C037 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms