Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSPO3Q9BXY4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms