Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD1Q9BXT4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms