Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms