Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms