Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms