Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF4Q96M43 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF4Q96M43 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms