Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CELF6Q96J87 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CELF6Q96J87 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms