Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM12Q96EX1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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