Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms